Fue fundada el 11 de noviembre de 1957. Es una agrupación de carácter científico, integrada por profesionales cubanos de esta especialidad y forma parte del Consejo Nacional de Sociedades Científicas de la Salud (CNSCS).
Sus miembros fundadores fueron:
1. Dr. Edmundo Arias Segredo
2. Dr. Ignacio Calvo Tarafa
3. Dr. Lorenzo Del portillo Puig
4. Dr. Enrique Ducassi y López-doriga
5. Dr. Oscar García Fernández
6. Dr. Joaquín Fernández Meléndez
7. Dr. Enrique Figares Camposa
8. Dr. Manuel Gómez Balseiro
9. Dr. Armando Gutiérrez Vals
10. Dr. Demetrio López González
11. Dr. Ramón Ogaisún Larrea
12. Dr. Carlos Reyes Zúñiga
13. Dr. Reynaldo Togores Álvarez
Relación de presidentes de la Junta de Gobierno
I. Dr. Ignacio Calvo Tarafa – 11/1957 a 2/1960
II. Dr. Enrique Figares Camposa – 3/1960 a 1963
III. Dr. Reynaldo Togores Álvarez – 1963 a 1971
IV. Dr. Manuel Andina Teijido – 1971 a 1975
V. Dr. Oscar García Fernández – 1975 a 1982
VI. Dr. Edmundo Arias Segredo – 1982 a 1988
VII. Dr. Luis Ernesto Villasana Roldós – 1988 a 2008
VIII. Dr. Francisco Fidel Llorente Llano – 2008
Datos tomados del Archivo de la Sociedad Cubana de Coloproctología en el Consejo Nacional de Sociedades Científicas de la Salud