Proteómica dirigida como método del año 2012

La proteómica dirigida se refiere a la detección, cuantificación y caracterización de proteínas específicas de interés en muestras biológicas.

Históricamente, los reactivos de los anticuerpos han sido ampliamente utilizados por los biólogos para la detección de las proteína, pero la tecnología de espectrometría de masas ha sido objeto de una rápida evolución en los últimos años, abriendo nuevas aplicaciones en biología de sistemas y en la investigación traslacional. Metodologías desarrolladas recientemente permiten monitorear las proteínas de interés con alta sensibilidad, exactitud cuantitativa y reproducibilidad por espectrometría de masas.

Un enfoque emergente fundamental en el análisis dirigido del proteoma es el llamado monitoreo de reacción seleccionada (SRM en inglés), donde un espectrómetro de masas es programado para detectar señales de varias proteínas específicas. Paralelamente, ya se vislumbran nuevos enfoques que superan algunas de las limitaciones del SRM. En conclusión, la tecnología de espectrometría de masas está preparada para cambiar la forma en que los biólogos estudian las proteínas.

La revista Nature Methods ha seleccionado la proteómica dirigida como el Método del Año 2012 y presenta una selección de artículos sobre el desarrollo tecnológico y sus aplicaciones en la investigación básica y traslacional. La sección Methods to Watch, ofrece un vistazo a los posibles futuros Métodos del Año.

Los artículos están a texto completo.

Editorial
Method of the Year 2012
New method and tool developments are helping to bring targeted proteome analysis technologies to a broader array of biologists.

Abstract – | Full Text – Method of the Year 2012 | PDF (71 KB) – Method of the Year 2012

News Feature
Targeted proteomics- Vivien Marx

Analysis of a preselected group of proteins delivers more precise, quantitative, sensitive data to more biologists. Vivien Marx reports.

Primer
Mass spectrometry–based targeted proteomics- Allison Doerr

A brief overview of mass spectrometry technology for targeted proteomics applications is presented.

Commentary
Proteomics meets the scientific method –Paola Picotti, Bernd Bodenmiller & Ruedi Aebersold

By delivering precise, reproducible quantification of proteins of interest in biological samples, targeted proteomics approaches are allowing researchers to apply the scientific method using mass spectrometry.

Perspective
Quantitative analysis of peptides and proteins in biomedicine by targeted mass spectrometry –Michael A Gillette & Steven A Carr

The role of targeted mass spectrometry technology in the field of clinical proteomics is discussed in this Perspective.

Methods to Watch
Disruptive nanopores –Nicole Rusk

2013 will see the first commercial nanopore sequencers.

Probing microbiome function –Tal Nawy

In studies of microbiome function, marker sequencing will be balanced by alternative profiling approaches.

Near-infrared probes –Erika Pastrana

Development of genetically encoded tools with absorption and emission spectra in the near infrared is worth the trouble.

Defective (but useful) diamonds –
Daniel Evanko

Nitrogen vacancy center defects in diamonds confer remarkably useful properties.

In vitro niches–Natalie de Souza

Attempts to replicate the stem cell microenvironment in the culture dish continue.

Volumetric imaging in a snapshot – Erika Pastrana

Microscopes that render tissue-volume images from single snapshots are making their way into biology.

Mass spectrometry of intact protein complexes – Allison Doerr

Mass spectrometry technology to detect and characterize large, intact protein complexes is becoming more accessible.

Machines learn phenotypes -Natalie de Souza

Automated classifiers speed up biological phenotyping.

 

Este anuncio ha sido una colaboración de:
Tania Izquierdo Pamias
Especialista en Gestión de Información
Centro Nacional de Información de Ciencias Médicas, Infomed
La Habana, Cuba